LF HK – BBMRI-CZ: Síť biobank – Spotřební materiál a reagencie pro sekvenátor Miniseq
Královéhradecký malaPopis poptávky
Sekvenační chemie je nezbytným předpokladem pro realizaci (spuštění a provedení) sekvenačních běhů na přístroji MiniSeq. Při samotném procesu sekvenace je nejdříve v laboratoři připravena tzv. sekvenační knihovna- koncentrovaná směs vybraných DNA fragmentů s navázanými oligonukleotidy odpovídajícími jednotlivým vzorkům (indexy) a oligonukleotidy pro provedení sekvenace (adaptory). Tato knihovna je dále sekvenována na NGS (Next-Generation Sequencing) přístroji, kdy pomocí sekvenační chemie na flowcell proběhne tvorba klastrů a sekvenační reakce. Požadovaná sekvenační chemie bude využita k analýzám nádorové DNA získané z tkáně fixované formalinem a zalité do parafinu. Bude sloužit k sekvenování knihoven DNA připravených technologií cíleného obohacení k vyhledávání a mnohonásobné porovnávání jednobodových mutací (SNPs), delecí, inzercí, variací v počtu kopií (CNV), sekvenaci složitých oblastí genomu (GC-bohaté oblasti, oblasti homopolymerů, oblasti s repetitivními sekvencemi). Sekvenační chemie musí být kompatibilní se sekvenátorem MiniSeq (Illumina).Informace o zakázce
Typ: Podlimitní
Evidenční číslo zakázky: Z2019-000963
Zadávací řízení: F02
Zadavatel-název/jméno: Univerzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Králové
IČ zadavatele: 00216208
Datum zveřejnění: 14.01.2019
Země: Česká republika
CPV: 33696500
Evidenční číslo zakázky: Z2019-000963
Zadávací řízení: F02
Zadavatel-název/jméno: Univerzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Králové
IČ zadavatele: 00216208
Datum zveřejnění: 14.01.2019
Země: Česká republika
CPV: 33696500
Podrobné informace o zadavateli a zakázce
Detaily zakázky: Bude zobrazeno po přihlášení.